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Sven Saupe est généticien. Il est directeur de recherche au CNRS, à l’Institut de Biologie et Génétique Cellulaires (CNRS UMR5095). En biologie, il s’intéresse à la question de la reconnaissance du non-soi chez les champignons. Il mène aussi un travail interdisciplinaire portant sur certaines implications symboliques et sociales de la génétique moléculaire et de la génomique ainsi que sur les liens entre ADN et individualité dans la philosophie de Hans Jonas, et une réflexion sur les machines désirantes de Deleuze et Guattari dans le contexte de la biochimie des protéines.
La technologie métagénomique, basée sur les performances nouvelles du séquençage de l’ADN, pose comme horizon la détection exhaustive des ADNs présents dans un environnement (naturel ou urbain, bâti public ou domestique, corporel ...